Этидиум бромид

Нет в наличии

Этидиум бромид (этидиум бромид, CAS 1239-45-8, C21H20BrN3, M 394,31 г/моль) — флуоресцентный интеркалирующий краситель марки AR ≥98% поставщика в виде красно-фиолетового кристаллического порошка. Вставляется между парами оснований двуспиральной ДНК и РНК, усиливая флуоресценцию почти 20-кратно; при UV-освещении полосы видны оранжевым (λem ~590–605 нм). Концентрация для окраски геля 0,5–1,0 µg/ml в воде или в геле 0,5 µg/ml в агарозе. Растворим в воде и буферах электрофореза. Хранить в темноте при комнатной температуре; потенциальный мутаген — работа в СИЗ.

Основные применения

  • Визуализация ДНК и РНК после агарозного электрофореза
  • в геле и после электрофореза при 0,5–1,0 µg/ml
  • Контроль молекулярно-биологических проб в НИИ

Стандарты и документы

AR ≥98%; контроль чистоты для аналитической марки производителя.

Характеристики

CAS
1239-45-8
Формула
C21H20BrN3
Молярная масса
394,31 г/моль
Класс вещества
флуоресцентный интеркалирующий краситель нуклеиновых кислот
Внешний вид
Красно-фиолетовый кристаллический порошок
Растворимость
Растворим в воде и буферах для электрофореза
Температура хранения
+15…+25 °C, темнота
Класс опасности
Потенциальный мутаген; обращение по SDS

Применение по отраслям

Окраска агарозных гелей

после электрофореза: гель в 0,5–1,0 µg/ml 15–60 мин, опциональная дестейнинг в воде 15–30 мин. в геле: 0,5 µg/ml в расплавленной агарозе до заливки. Детекция на UV-трансиллюминаторе 254–312 нм; лимит 0,5–5,0 ng/полосу. Флуоресценция увеличивается 21–25-крат при связывании с ДНК/РНК. может слегка изменять мобильность ДНК при окрашивание в геле.

Марка AR 98% производителя

Аналитическая марка AR ≥98% производителя для исследовательских лабораторий с CoA на чистоту. Применяют также в флуориметрических определениях нуклеиновых кислот, задержка миграции в геле содержание и оценке жизнеспособности клеток в сочетании с акридиновый оранжевый.

Практические нюансы

после электрофореза протокол

Гель в 0,5 µg/ml 15–30 мин → опционально вода 15 мин → UV 254 nm. Детекция от 1 ng нуклеиновых кислот. Для РНК — короче окрашивание и обесцвечивание.

Параметры AR 98%

CAS 1239-45-8; C21H20BrN3; M 394,31; ≥98% AR; λex 526 nm, λem 605 nm; растворим в воде; хранение в темноте.

Мутагенность и практика

— сдвиг рамок мутаген при интеркалиации. Низкая мутагенность без метаболической активации. Лаборатории используют СИЗ, UV-защиту и регламентированную утилизацию.

Хранение и безопасность

Условия хранения
Темнота, +15…+25 °C, герметичная тара.
Меры безопасности
Перчатки, очки; UV-защита при визуализации; не отбрасывать в канализацию без обработки.
Перевозка
По SDS производителя.
Вентиляция
Вытяжка при приготовлении концентрированных растворов.
Температурный режим
+5…+30 °C
Тара
Тёмная или обёрнутая банка.

Частые вопросы

Какая концентрация для окраски геля?
после электрофореза: 0,5–1,0 µg/ml в воде 15–60 мин. в геле: 0,5 µg/ml в агарозе. раствор 10 mg/ml в воде — разбавлять перед использованием.
Почему флуоресценция усиливается при связывании с ДНК?
Интеркалиация в гидрофобную среду между основаниями вытесняет воду — кварчер флуоресценции; усиление ~20-крат по сравнению с свободным
Безопасные альтернативы?
SYBR безопасный, SYBR Green, гель-краситель — меньшая мутагенность в теста Эймсатесте, но дороже. остаётся стандартом в исследовательских лабораториях при соблюдении СИЗ.
Влияет ли на размер полос?
окрашивание в геле может изменить мобильность ДНК; для точного определения размеров предпочтительнее после электрофореза или сравнение с шкалой размеров без в геле.
Как утилизировать?
Обработка гипохлоритом натрия или сбор на активированный уголь/ионообменник перед утилизацией. Не сливать необработанный в канализацию.
Чистота AR 98% производителя?
В CoA указано ≥98% для аналитической марки; перед критичными экспериментами сверяют спектрофотометрию и пригодность для электрофорез.